確かな手応えを感じた第１回演奏会ではあったが、第２回目の演奏会をまえにして変動が起こった。結成をリードした尺八の村岡実、そして箏メンバーの山内喜美子、上参郷美枝も退団。ポピュラー路線を想定していた村岡らにとっては意に沿わないものだったらしい。
　東京尺八三重奏団はあえなく解散。日本音楽集団第２回演奏会での尺八には山本邦山を賛助に迎え、宮田耕八朗・横山勝也とのトリオが実現した。箏メンバーには泉会の白根きぬ子、野坂恵子を迎え、宮本幸子とのコンビで箏セクションが固まって行った。


　私たち日本音楽集団も結成以来３年目を迎えて、ここに第３回定期演奏会を行うことになりました。鼻息ばかりが荒かった第１年目、いろいろと問題の多かった第２年目を過ぎ、石の上にも３年という第３年目がやってまいりました。― 中略 ―　私たちは、日本の音楽を愛し、よりよく発展させたいと願う演奏家と作曲家の集まりであります。私たちは日本の音楽の伝統を十分に尊重し、その魂を学びとりながら、流派やしきたりにこだわらず、新しい日本の音楽を創るために大いに努力してまいりたいと考えております。
　私たちの活動はすべて「演奏」に集約されます。とりわけこの定期演奏会こそ私たちのすべてのエネルギーを注ぎ込む大切な行事であります。― 後略 ―　
昭和４１年６月　日本音楽集団一同


　日本の音には、笛は欠かせないもの。第２回演奏会で賛助出演した向山栄一郎（現：望月太八）が参加、以降同人となった。
　作曲家は待っていましたとばかりに笛入りの曲を試みる。

第４回定期演奏会（1966年10月24日第一生命ホール）において組曲「人形風土記」（１：二ポポ、２：こけし、３：のろま人形、４：流しびな、５：キジ馬、６：木うそ）長澤勝俊作曲、「古代舞曲によるパラフレーズ」（１：前奏曲、２：相聞、３：田舞、４：誄歌、５：?歌）三木稔作曲の名曲が生まれた。
　"水を得た魚のように"という言葉があるが、これらの曲は、笛が入ってこそまさに「日本の音」「日本の響き」になったのだ。



（１）バッハ・管弦組曲第２番より／日本音楽集団編曲が登場！
ロンド、ポロネーズ、バディネリ
（２）古代舞曲によるパラフレーズ／三木稔作曲（昭41年度NHK委嘱作品）
（３）四つの締め太鼓・横笛・祭太鼓による小組曲「ともし火に寄せて」／芝祐靖作曲
（４）子供の四季／長澤勝俊作曲（昭41年度NHK委嘱作品）
　ソプラノ：増田睦美　バリトン：池田明良　合唱：荒川少年少女合唱隊
　指揮：秋山和慶

　バッハの管弦楽組曲は、単に日本楽器にうつしかえたということではない。新しいオーケストレーションによって驚くほど新鮮な、眼をみはるような音楽に生まれ変わってしまった。（鞍掛昭二）

　創立3年目を迎えた日本音楽集団の面々には、何とも言えない「自信」のようなものが芽生えた時期であり、バッハにも挑戦しようという機運が高まっていた。上記鞍掛ディレクターの記したコメントには彼もいうように決して傲慢なものではなく、日本の楽器で歌うバッハには西洋楽器とは違う日本的な味わいが出せるのではないかとの思いがこもっていた。